3月28日,美國農(nóng)業(yè)部部長Sonny Perdue在一項(xiàng)聲明中說,一些基因編輯的作物將不受監(jiān)管。2016年以來,美農(nóng)業(yè)部就放行了一些基因編輯的作物,這次表態(tài)可以說進(jìn)一步確認(rèn)立場。
對基因工程包括轉(zhuǎn)基因的監(jiān)管,美國大體針對產(chǎn)品而非技術(shù)。這一策略保證了其農(nóng)業(yè)的全球領(lǐng)先地位。目前看,在基因編輯技術(shù)為作物育種帶來革命性變化的今天,美國將繼續(xù)引領(lǐng)世界;相較之下,歐洲和中國已然落后。
廣譜抗白粉病小麥:中國學(xué)者變不可能為可能
2014年7月,中科院遺傳所高彩霞和微生物所邱金龍課題組合作的研究發(fā)表在Nature Biotechnology上。他們創(chuàng)制了一種新型的小麥品種廣譜抗白粉病小麥,對白粉病具有廣譜和持久的抗性。說來也簡單,他們只是在小麥基因組的170億個(gè)堿基中*地刪除了某幾個(gè)。這在以前是沒辦法做到的。
“小麥?zhǔn)橇扼w(AABBDD),在普通小麥A、B、D基因組上MLO基因各有一個(gè)拷貝,我們利用基因組編輯技術(shù)*對這三個(gè)拷貝同時(shí)進(jìn)行了突變,獲得了對白粉病有廣譜抗性的小麥。”邱金龍說。
通過這一實(shí)驗(yàn),他們還明白了為什么小麥不會(huì)通過天然突變獲得和大麥一樣的廣譜抗性。在實(shí)驗(yàn)中,他們獲得了35個(gè)MLO基因的突變體,有單拷貝、雙拷貝,也有三拷貝的突變。他們將這些突變體進(jìn)一步自交,獲得了MLO基因不同組合的純合突變體后代(aa, bb, dd, aabb, aadd, bbdd, aabbdd),才發(fā)現(xiàn)只有aabbdd,也就是MLO基因在小麥A、B和D基因組上的三個(gè)拷貝同時(shí)突變的植株才有廣譜抗性。
“大麥?zhǔn)嵌扼w,小麥?zhǔn)橇扼w,每個(gè)基因組有三個(gè)拷貝,就有六個(gè)等位基因。自然狀態(tài)下,六個(gè)等位基因同時(shí)突變的幾率幾乎是零,這就是為什么不存在天然突變的MLO廣譜抗白粉病的小麥。”邱金龍說。
業(yè)內(nèi)稱基因編輯為“類天然突變”
基因編輯技術(shù)得益于幾種核酸酶的設(shè)計(jì)與使用。這些核酸酶的共同特點(diǎn)是,它們可以在你想要的DNA位點(diǎn)處產(chǎn)生雙鏈斷裂,可以理解為“指哪打哪”。隨后,細(xì)胞內(nèi)的固有修復(fù)機(jī)制被激活,對損傷處產(chǎn)生有效的基因修改。
細(xì)胞內(nèi)對DNA雙鏈斷裂的修復(fù)有兩條途徑:一種叫非同源末端連接,簡稱NHEJ;另一種叫同源重組,簡稱HR。相比較,NHEJ是主要的修復(fù)機(jī)制,通常帶來的是少量堿基的丟失,很少情況下也會(huì)有堿基插入。NHEJ實(shí)現(xiàn)起來相對簡單,成為研究基因功能的良好手段。
基因敲除后的突變體,只是缺失了幾個(gè)堿基,和自然突變以及用化學(xué)試劑、X-射線等人工誘變產(chǎn)生的突變體沒有區(qū)別。“這也給檢測帶來了困難,因?yàn)槎吆茈y做出區(qū)分。”清華大學(xué)教授謝震說。
對于上述基因敲除的蘑菇、玉米,美國農(nóng)業(yè)部已經(jīng)表示不在其監(jiān)管范圍之內(nèi)。
“我們把它們稱之為類天然突變。”邱金龍說。實(shí)際上,不僅*終產(chǎn)品與常規(guī)育種類似,運(yùn)用基因編輯技術(shù)還更*、簡單、直接;而傳統(tǒng)的雜交往往導(dǎo)致基因組大片段的交換,即使是誘變育種也導(dǎo)致隨機(jī)的幾千個(gè)突變,需要大規(guī)模的后代篩選,費(fèi)時(shí)費(fèi)力。
不僅產(chǎn)品,過程亦不涉及轉(zhuǎn)基因。
當(dāng)然,細(xì)究廣譜抗白粉病小麥的創(chuàng)制過程也并非“無懈可擊”。核酸酶是蛋白,如果該蛋白的編碼DNA,或者連同攜帶這段DNA的質(zhì)粒導(dǎo)入了植物細(xì)胞,隨機(jī)整合進(jìn)入植物的染色體中,那也是有外源DNA的插入了。
一個(gè)解決辦法是,在核酸酶表達(dá)和植物生成之后,進(jìn)一步篩選把含有重組DNA的植物去除。能做到這點(diǎn)緣于起初設(shè)計(jì)的兩個(gè)位點(diǎn)并不挨在一起。這兩個(gè)位點(diǎn),一個(gè)是插入核酸酶的編碼DNA的位點(diǎn),另外一個(gè)是核酸酶的作用位點(diǎn)。這兩個(gè)位點(diǎn)離得較遠(yuǎn),即使核酸酶的編碼DNA整合到了植物的染色體中,之后也可以通過回交分離,留下僅攜帶期望的DNA序列改變的植株后代。
雜交篩選的過程費(fèi)時(shí)費(fèi)力,而且核酸酶的DNA的穩(wěn)定表達(dá)會(huì)增加脫靶以及嵌合體發(fā)生的概率。脫靶和核酸酶的特異性相關(guān),指的是由于某些DNA片段的相似,核酸酶“不小心”把類似的位點(diǎn)也切割了。好在基因編輯技術(shù)的快速發(fā)展已經(jīng)可以實(shí)現(xiàn)所謂的“瞬時(shí)表達(dá)”,克服了這些缺點(diǎn)。
*種方式,使用農(nóng)桿菌、基因槍或原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化將核酸酶的編碼DNA或RNA傳遞至植物細(xì)胞。當(dāng)將核酸酶的編碼DNA構(gòu)建體運(yùn)送至細(xì)胞時(shí),“瞬時(shí)表達(dá)”常常產(chǎn)生。在表達(dá)完核酸酶之后,DNA構(gòu)建體迅速降解,沒有機(jī)會(huì)整合入植物基因組。
例如2016年8月,高彩霞研究組通過CRISPR/Cas9 DNA或RNA“瞬時(shí)表達(dá)”,對六倍體小麥及四倍體小麥的7個(gè)不同基因進(jìn)行了定點(diǎn)敲除,直接得到了不含外源基因的小麥純合敲除突變體,而且沒有檢測到脫靶效應(yīng)。“這就是瞬時(shí)起的作用,就相當(dāng)于揮舞大刀砍人,砍到了敵人,但也傷到了朋友,砍敵人時(shí)間越長,傷到朋友的概率就更大。所以,‘瞬時(shí)表達(dá)’就會(huì)降低脫靶,也表明準(zhǔn)確性更高。”邱金龍說。
不過,CRISPR/Cas9 DNA進(jìn)入細(xì)胞后,也有可能把降解后的小DNA片段整合到植物的基因組中,如何從根本上杜絕DNA或RNA進(jìn)入細(xì)胞呢?
升級后的方法就是把核酸酶以蛋白質(zhì)的形態(tài)直接運(yùn)送至植物細(xì)胞。目前,通過基因槍直接將在體外組裝成的核糖核蛋白復(fù)合體(由Cas9蛋白和引導(dǎo)RNA組成)運(yùn)送到玉米的胚胎中,并生成了不含轉(zhuǎn)基因的玉米。高彩霞團(tuán)隊(duì)也用了類似方法,生成的小麥不僅從*終產(chǎn)品上無外源DNA,而且在整個(gè)過程無外源DNA。
同樣強(qiáng)大的還有目前快速發(fā)展的堿基編輯技術(shù)。“還有一些表觀遺傳修飾的技術(shù),DNA序列根本沒有改變,但也會(huì)產(chǎn)生新的性狀。”謝震說。當(dāng)然,表觀遺傳修飾技術(shù),如RdDM,產(chǎn)生的植物是否可以稱為突變體也值得商榷,因?yàn)楹塑账嵝蛄胁]有發(fā)生任何的改變。
總之,基因編輯技術(shù)的發(fā)展已經(jīng)不僅可以獲得無轉(zhuǎn)基因的植物,而且全程都不涉及轉(zhuǎn)基因。
學(xué)者:監(jiān)管應(yīng)評估*終產(chǎn)品而非過程
另外一種修復(fù)途徑HR會(huì)復(fù)雜些。HR通過基因替代或者插入來實(shí)現(xiàn)*的基因編輯,需引入與斷裂處原序列類似的DNA修復(fù)模版。該模版通過同源重組拷貝到染色體處,達(dá)到修復(fù)目的。
HR潛力巨大。不僅是添加基因,HR也可以通過改變基因編碼區(qū)的關(guān)鍵氨基酸殘基,或者改變啟動(dòng)子或控制基因表達(dá)的其他順式作用元件獲得新的性狀。
堿基的插入和替換有可能觸發(fā)監(jiān)管。不過,若與傳統(tǒng)的雜交育種相比,如果是將自然界中已經(jīng)存在的可雜交物種中的同源基因定向?qū)耄瑒t沒有理由不接受——因?yàn)?,原則上講,這樣的作物用雜交育種也能做到,只不過更加耗時(shí)。更為棘手的是,沒有辦法可以在這兩種方法創(chuàng)制的產(chǎn)品之間做出區(qū)分。*的不同是,傳統(tǒng)雜交耗時(shí)、準(zhǔn)確性低,經(jīng)常連帶將附近的一大段DNA也引入了進(jìn)去,可能有副作用。
那么,如果通過HR導(dǎo)入的是可雜交的物種的同源基因,不是不可雜交的物種的外源DNA,是否可以獲得豁免呢?另外,到底多大數(shù)量的堿基改變才觸發(fā)監(jiān)管呢?這些問題懸而未決。
不過,在一些專家看來,考慮技術(shù)實(shí)現(xiàn)過程中是否涉及到轉(zhuǎn)基因,思路本質(zhì)上就是錯(cuò)誤的。2016年,美國競爭性企業(yè)研究所的Gregory Conko和另外三位學(xué)者強(qiáng)調(diào),監(jiān)管必須集中在實(shí)際的風(fēng)險(xiǎn),而風(fēng)險(xiǎn)只是由經(jīng)過修飾的*終產(chǎn)品所帶來的,與所使用的方法毫無關(guān)系。對*終產(chǎn)品進(jìn)行評估而不是對創(chuàng)制產(chǎn)品的過程進(jìn)行監(jiān)管代表了科學(xué)界的主流意見。
生在中國,卻長在美國的試驗(yàn)田里。
2009年,當(dāng)邱金龍從歐洲回到中國,準(zhǔn)備用新出現(xiàn)的基因編輯技術(shù)TALEN來創(chuàng)制對白粉病有廣譜抗性的小麥時(shí),他的合作者高彩霞也從歐洲回國。
“在歐洲,我們?nèi)ソ榻B的時(shí)候,科研人員還不習(xí)慣使用這一新技術(shù),歐洲相對比較保守。在中國,我們的植物基因組編輯研究在國際上還是領(lǐng)先的,并且得到了快速廣泛的應(yīng)用。”邱金龍說。歐洲對轉(zhuǎn)基因的保守,已經(jīng)導(dǎo)致其產(chǎn)品開發(fā)和產(chǎn)業(yè)的落后。
Gregory Conko等人認(rèn)為,美國對待基因工程技術(shù)的態(tài)度相對要寬松。美國食藥監(jiān)局集中評價(jià)產(chǎn)品。美國環(huán)保署集中考慮抗蟲特性。美國農(nóng)業(yè)部發(fā)明了“植物害蟲”(Plant pest)一詞,關(guān)注在基因工程作物的創(chuàng)制過程中是否用到植物病原體。對于新興的植物編輯技術(shù),目前,白宮命令農(nóng)業(yè)部、食藥局、環(huán)保署更新其監(jiān)管的協(xié)調(diào)框架來應(yīng)對,廣泛收集民眾的意見。
傳統(tǒng)育種已經(jīng)無法滿足不斷增長的食物需求和氣候變化等挑戰(zhàn)。如果還是通過發(fā)現(xiàn)自然的變異后雜交育種,甚至加上60年前發(fā)展的誘變育種,作物改良也將不可持續(xù)。“傳統(tǒng)的雜交育種,假設(shè)很幸運(yùn)能找到一個(gè)抗病植株,但一般它產(chǎn)量不高,那就需要和產(chǎn)量高的進(jìn)行雜交,雜交后還要經(jīng)過多代的優(yōu)化分離,一般要至少十年以上。”邱金龍說。
然而,歐洲的科學(xué)家Maria Lusser等人曾指出,不利的監(jiān)管環(huán)境導(dǎo)致的高成本(每轉(zhuǎn)基因事件3500萬美元)和費(fèi)時(shí)(需要5.5年才能完成),使得只有一些高利潤的作物獲得大規(guī)模種植,如棉花、大豆和玉米;一些冷門的作物比如蔬菜和園藝品種則無人問津。
“我覺得基因編輯如果法規(guī)足夠?qū)捤?,不需要大公司去做,很利于中國的小公司去?chuàng)新。我們給科學(xué)院寫過材料,用了一個(gè)很俗的名詞,說可以實(shí)現(xiàn)中國育種產(chǎn)業(yè)的彎道超車;中國有2000多家種子公司,大都是小公司,沒法和國外的跨國公司競爭。”邱金龍說。
在植物育種領(lǐng)域,我們正站在一個(gè)變革的十字路口,也許是一場雙重的范式轉(zhuǎn)換:一方面,潛力巨大的植物編輯技術(shù)正在革新行業(yè)面貌;另一方面,以過程為基礎(chǔ)的監(jiān)管策略已經(jīng)不合時(shí)宜。
中國將如何應(yīng)對?我們只能從一些學(xué)術(shù)會(huì)議上聽到只言片語的“建議”,即使是這個(gè)領(lǐng)域的科學(xué)家,也小心謹(jǐn)慎。而誕生于中國實(shí)驗(yàn)室的廣譜抗白粉病小麥,因無需受到轉(zhuǎn)基因的監(jiān)管,正茁壯地生長在美國的試驗(yàn)田里。
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