近日,The plant journal在線發(fā)表了山東農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院王秀玲團隊與美國University of Wisconsin-Madison的Marisa S. Otegui教授合作完成的題為“AtBUD13 affects pre-mRNA splicing and is essential for embryo development in Arabidopsis”的研究論文,揭示了擬南芥剪接因子AtBUD13通過影響基因的剪接調(diào)控胚的早期發(fā)育。
在高等植物中,胚的形態(tài)建成伴隨著一系列程序性的細(xì)胞分裂和細(xì)胞分化,該過程中受到一系列特定基因的時空表達調(diào)控。Pre-mRNA剪接是基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的重要途徑,對基因表達及蛋白合成至關(guān)重要。在真核生物中,Pre-mRNA的剪接過程主要由剪接復(fù)合體完成。剪接復(fù)合體是一個龐大的核糖核蛋白復(fù)合體,主要是由U1、U2、U4、U5、U6五個核心SnRNP以及大量的非SnRNP蛋白組成。近年來,隨著結(jié)構(gòu)生物學(xué)的發(fā)展,酵母和人的剪接復(fù)合體的三維結(jié)構(gòu)已被解析,人們對于剪接復(fù)合體的認(rèn)識也越來越深入。但是與人和酵母中的研究相比,人們對于植物剪接體的了解還不夠深入,尤其是對其生物學(xué)功能的研究還相對較少。pre-mRNA retention and splicing complex(RES)復(fù)合體是一個非SnRNP的異源三聚體,*初在酵母中被報道,隨后在其他物種中(線蟲、斑馬魚、人)也相繼被發(fā)現(xiàn)。RES復(fù)合體能通過直接與Pre-mRNA結(jié)合而介導(dǎo)某些特定基因的剪接,此外RES復(fù)合體還在剪接復(fù)合體的組裝中起作用。但是植物中是否存在RES復(fù)合體還未見報道。
在酵母中,RES復(fù)合體由Bud13p、Snu17p和Pml1p三個非SnRNP亞基組成。該研究發(fā)現(xiàn)模式植物擬南芥At1G31870編碼酵母Bud13p的同源蛋白AtBud13。AtBUD13在各個發(fā)育時期的胚中高量表達。該基因功能缺失突變體的雜合體中有約25%的胚自合子時期分裂模式異常,進而被降解導(dǎo)致種子敗育,表明純合突變體致死。RNA-seq分析顯示,AtBUD13突變導(dǎo)致了1,932不正常的剪接事件,主要表現(xiàn)為內(nèi)含子保留,尤其是長度較短的內(nèi)含子(≤100堿基)。在這些剪接異常的基因中,包括52個胚早期發(fā)育關(guān)鍵基因。GO功能分析顯示AtBUD13參與調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄、DNA重組和RNA加工等核酸代謝過程。該研究*次鑒定了植物中存在RES復(fù)合體的BUD13亞基并參與胚發(fā)育的調(diào)控,該研究為進一步鑒定植物RES復(fù)合體奠定了基礎(chǔ)。
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