近日,Horticulture Research在線發(fā)表了大連理工大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院欒雨時(shí)教授課題組完成的題為“Tomato lncRNA23468 functions as a competing endogenous RNA to modulate NBS-LRR genesby decoying miR482b in the tomato- Phytophthora infestans interaction”的論文。該成果是在國(guó)家自然科學(xué)基金的資助下,他們長(zhǎng)期致力于番茄抗病相關(guān)非編碼RNA的研究,發(fā)表二十余篇miRNA(Horticulture Research, 2018, 5:9; Plant Cell and Environment, 2018, doi: 10.1111/pce.13468;等)及多篇lncRNA(The Plant Journal, 2017, 89: 577-589; The Plant Journal, 2018, doi:10.1111/tpj.14173; 等)論文的基礎(chǔ)上,將miRNA與lncRNA協(xié)同調(diào)控的作用綜合研究的產(chǎn)物。該文不僅有利于加深人們對(duì)番茄抗晚疫病機(jī)制的理解,還可為其他植物非編碼RNA的研究提供參考。
miR482b負(fù)調(diào)控番茄的抗性,過(guò)表達(dá)它的植株易感晚疫病。葉片接種病原菌后,miR482b的表達(dá)量顯著降低,但其作用機(jī)制尚不清楚。該文作者編寫(xiě)了特定程序,從番茄RNA-Seq數(shù)據(jù)中鑒定出89個(gè)具有原始內(nèi)源靶標(biāo)模擬物(eTM)的lncRNA,可沉默46個(gè)miRNA。研究發(fā)現(xiàn)lncRNA23468、lncRNA01308和lncRNA13262均含有miR482b的保守eTM位點(diǎn)。當(dāng)lncRNA23468在番茄中過(guò)表達(dá)時(shí),miR482b及其靶基因NBS-LRR的表達(dá)分別出現(xiàn)顯著的降低和升高,抗病性得以增強(qiáng);而沉默lncRNA23468則導(dǎo)致miR482b的積累,NBS-LRR減少,抗病性下降。將lncRNA23468的eTM位點(diǎn)突變(mlncRNA23468)后,未造成miR482b、NBS-LRR及植株抗病性的顯著改變。說(shuō)明lncRNA作為eTM可調(diào)控miRNA,lncRNA23468-miR482b-NBS-LRR相互作用影響著番茄對(duì)晚疫病的抗性。
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