中國(guó)農(nóng)機(jī)院呼和浩特分院始建于1960年，由原農(nóng)業(yè)機(jī)械部以農(nóng)機(jī)干徐字（1960）第77號(hào)文件批準(zhǔn)設(shè)立。曾用名內(nèi)蒙古畜牧機(jī)械研究所、機(jī)械工業(yè)部呼和浩特畜牧機(jī)械研究所等。1998年12月7日，原國(guó)家機(jī)械工業(yè)局以國(guó)機(jī)改（1998）第568號(hào)文《關(guān)于同意中國(guó)農(nóng)業(yè)機(jī)械化科學(xué)研究院與呼和浩特畜牧機(jī)械研究所合并的通知》批復(fù)，機(jī)械工業(yè)部呼和浩特畜牧機(jī)械研究所合并到中國(guó)農(nóng)業(yè)機(jī)械化科學(xué)研究院。2000年1月7日，原國(guó)家經(jīng)濟(jì)貿(mào)易委員會(huì)和國(guó)家科學(xué)技術(shù)部以國(guó)經(jīng)貿(mào)技術(shù)（2000）第16號(hào)文《關(guān)于印發(fā)調(diào)整國(guó)家經(jīng)貿(mào)委管理的10個(gè)國(guó)家局所屬部分科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制方案的通知》，確定機(jī)械工業(yè)部呼和浩特畜牧機(jī)械研究所并入中國(guó)農(nóng)業(yè)機(jī)械化科學(xué)研究院，定名為中國(guó)農(nóng)業(yè)機(jī)械化科學(xué)研究院呼和浩特分院，轉(zhuǎn)制為中央直屬科技型企業(yè)。
呼和浩特分院位于內(nèi)蒙古自治區(qū)首府呼和浩特市賽罕區(qū)昭烏達(dá)路506號(hào)，院本部及下屬海拉爾試驗(yàn)站站區(qū)占地面積14萬(wàn)平方米，擁有呼和浩特中試生產(chǎn)基地、賽汗塔拉風(fēng)能實(shí)驗(yàn)場(chǎng)、和林飼養(yǎng)技術(shù)及裝備試驗(yàn)場(chǎng)、海拉爾低溫環(huán)境試驗(yàn)站及科技示范農(nóng)牧場(chǎng)，占地共7000多公頃。目前，呼和浩特分院擁有5個(gè)全資子公司、3個(gè)控股公司，下設(shè)7個(gè)研究所、中心等，現(xiàn)有從業(yè)人員720人，其中技術(shù)開(kāi)發(fā)人員197人，研究員13人，獲國(guó)務(wù)院頒發(fā)政府特殊津貼7人，*工程師68人。
呼和浩特分院是從事畜牧業(yè)裝備研究開(kāi)發(fā)并具有自營(yíng)進(jìn)出口業(yè)務(wù)權(quán)的科技型企業(yè)，也是*早從事可再生能源利用技術(shù)研究的科研單位之一。呼和浩特分院是“國(guó)家草原畜牧業(yè)裝備工程技術(shù)研究中心”、“內(nèi)蒙古畜牧業(yè)裝備工程技術(shù)研究中心”、“內(nèi)蒙古新能源工程技術(shù)研究中心”的依托單位。也是全國(guó)畜牧機(jī)械行業(yè)技術(shù)歸口單位，依托我院的公益性機(jī)構(gòu)主要有全國(guó)風(fēng)力機(jī)械標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)、中國(guó)農(nóng)業(yè)機(jī)械學(xué)會(huì)畜牧機(jī)械分會(huì)、機(jī)械工業(yè)畜牧機(jī)械產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)督檢測(cè)中心和機(jī)械工業(yè)風(fēng)力機(jī)械產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)督檢測(cè)中心等。
建院以來(lái)，呼和浩特分院形成了適應(yīng)我國(guó)畜牧業(yè)發(fā)展需要的草原建設(shè)與草原改良技術(shù)及裝備、飼草料收獲與貯存技術(shù)及裝備、牧草種子加工技術(shù)及裝備、飼草料制備與深加工技術(shù)及裝備、秸稈飼料轉(zhuǎn)化技術(shù)及裝備、畜產(chǎn)品采集與深加工技術(shù)及裝備、畜禽飼養(yǎng)技術(shù)及裝備、風(fēng)能太陽(yáng)能等可再生能源應(yīng)用技術(shù)與裝備研發(fā)等門類齊全的專業(yè)建制；造就了一批有較高學(xué)術(shù)水平的專業(yè)技術(shù)人才；共完成各類科研技術(shù)開(kāi)發(fā)項(xiàng)目845項(xiàng)，其中獲省部級(jí)以上科技成果獎(jiǎng)90項(xiàng)，擁有專利、專有技術(shù)69項(xiàng)。
呼和浩特分院為適應(yīng)市場(chǎng)經(jīng)濟(jì)體制，逐步完善了各項(xiàng)管理規(guī)章制度，2003年通過(guò)了ISO9001質(zhì)量和ISO14001環(huán)境體系認(rèn)證。
在本世紀(jì)的前十年，呼和浩特分院要繼續(xù)以科技創(chuàng)新帶動(dòng)產(chǎn)業(yè)發(fā)展，以產(chǎn)業(yè)發(fā)展促進(jìn)技術(shù)創(chuàng)新，形成人才匯萃、技術(shù)創(chuàng)新和經(jīng)濟(jì)持續(xù)增長(zhǎng)的良性循環(huán)格局，向具有國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)實(shí)力的科技企業(yè)集團(tuán)發(fā)展目標(biāo)邁進(jìn)。